Es señalado por su presunta participación en delincuencia organizada, operaciones de recursos de procedencia ilícita y defraudación fiscal.
La Fiscalía General de la República (FGR) 
solicitó a la Cámara de Diputados el desafuero del gobernador de Tamaulipas, Francisco Javier García Cabeza de Vaca. Es señalado por su presunta participación en delincuencia organizada, operación de recursos de procedencia ilícita y defraudación fiscal equiparada.
A través de su cuenta de Twitter, Francisco Javier García Cabeza de Vaca denunció que Morena ejerce “uso faccioso de la justicia donde no hay delito”. Se orquesta una embestida política. Esperaré a ser notificado para tener detalles y fijar mi posición. Nunca he violado la ley. Me defenderé ante cualquier atropello”, expresó.
Es militante del Partido Acción Nacional (PAN).
Fue electo gobernador de Tamaulipas para el periodo 2016-2022; ha sido diputado federal, local y alcalde de Reynosa.
Su hermano es el senador Ismael García Cabeza de Vaca.
López-Dóriga Digital